Pubblicazioni

Autori:

Gusinow, Roy; Górska, Anna; Canziani, Lorenzo Maria; Lopes-Rafegas, Iris; Alvarez Garavito, Carolina; Tami, Adriana; Gentilotti, Elisa; Sicuri, Elisa; Laouénan, Cédric; Ghosn, Jade; Florence, Aline-Marie; Lahfej, Nadhem; Mazzaferri, Fulvia; Del Piccolo, Lidia; Giannella, Maddalena; Toschi, Alice; Di Chiara, Michela; Caponcello, Maria Giulia; Palacios-Baena, Zaira R; Wold, Karin I; Rossi, Elisa; Tacconelli, Evelina; Hasenauer, Jan; Orchestra Study Group, ; Addis, Elena; Armellini, Maddalena; Azzini, Anna Maria; Barana, Benedetta; Bonato, Lucia; Carrara, Elena; Castelli, Alessandro; Cioli Puviani, Filippo; Conti, Michela; Cordioli, Raffaella; Cutone, Carmine; Davis, Ruth Joanna; De Nardo, Pasquale; Emiliani, Miriam; Esposito, Alessio; Fasan, Daniele; Fasani, Giada; Franchina, Giorgia; Garlasco, Jacopo; Gibbin, Enrico; Dall'O', Hermes Salvatore; Konishi De Toffoli, Chiara; Lambertenghi, Lorenza; Lattanzi, Federico; Leonardi, Andrea; Luca, Francesco; Maccarrone, Gaia; Mirandola, Massimo; Morra, Matteo; Nazeri, Alessandra; Rocchi, Matilde; Rosini, Giulia; Perlini, Chiara; Pezzani, Maria Diletta; Rovigo, Laura; Salvadori, Anna Giulia; Sartori, Andrea; Savoldi, Alessia; Scardellato, Rebecca; Sibani, Marcella; Sodano, Erica; Sorbello, Simona; Tavernaro, Lorenzo; Tomassini, Giorgia; Visentin, Alessandro; Vitali, Stefania; Volpe, Andrea; Zanchi, Chiara; Mazzali, Gloria; Stabile, Giovanni; Vantini, Gianluca; Cecchetto, Riccardo; Gibellini, Davide; Cardobi, Nicolò; Calì, Debora; Cecchini, Maria Paola; Marcanti, Maddalena; Mason, Anna; Monaco, Salvatore; Pattaro Zonta, Marco; Perlini, Cinzia; Zanusso, Gianluigi; Righi, Elda; Nunes Pinho Guedes, Mariana; Mongardi, Maria; Sciammarella, Concetta; Micheletto, Claudio; Gisondi, Paolo; Caroccia, Natascia; Bonazzetti, Cecilia; Tazza, Beatrice; Zeno Igor Adrien Pasquini, ; Marzolla, Domenico; Fornaro, Giacomo; Trapani, Fabio; Marconi, Lorenzo; Attard, Luciano; Tedeschi, Sara; Vituliano, Silvia; Gabrielli, Liliana; Lazzarotto, Tiziana; Rodrguez-Baño, Jesús; Mara Isabel Garcia Sánchez, ; Ana Belén Hidalgo Céspedes, ; Aurora Aleman Rodriguez, ; Lola Cubero Aranda, ; Paula Olivares Navarro, ; Sandra De La Rosa Riestra, ; José, M Bravo-Ferrero; Gerolf De Boer, ; Bernardina T, F Van Der Gun; Mara, F Vincenti-González; Alida C, M Veloo; Pantano, Daniele; Margriet Van Der Meer, ; Gard, Lilli; Erley, F Lizarazo; Knoester, Marjolein; Alex, W Friedrich; Hubert G, M Niesters; Cataudella, Salvatore; Dellacasa, Chiara; Huth, Manuel; Peiter, Clemens

Titolo:

Latent transition analysis for longitudinal studies of post-acute infection syndromes

Anno:

2026

Tipologia prodotto:

Articolo in Rivista

Tipologia ANVUR:

Articolo su rivista

Lingua:

Inglese

Formato:

Elettronico

Referee:

Sì

Nome rivista:

NATURE COMMUNICATIONS

ISSN Rivista:

2041-1723

N° Volume:

17

Numero o Fascicolo:

1

Intervallo pagine:

1-15

Parole chiave:

COVID-19; data set; infectious disease; longitudinal gradient; research method

Breve descrizione dei contenuti:

Post-Acute Infectious Syndromes (PAIS) refer to the symptoms persisting months after initial infection. Clinical research studies on this topic often collect rich, multi-modal datasets. Yet, the complexity of the datasets and the lack of a precise clinical case definition pose difficulties in creating comprehensive analyses. Here, we present a generalisable framework for analysing data from longitudinal studies of PAIS using Latent Transition Analysis (LTA). It enables the identification of disease phenotypes and the patient-level analysis of transitions between them, without relying on predefined clinical categorisations. Furthermore, we introduce a method for incorporating covariate information, which enables exploration of how patient characteristics influence disease trajectories. We apply this methodology to the ORCHESTRA dataset, composed of individuals affected by SARS-CoV-2 infection from multiple European centres, for investigation into Post-COVID-19 condition (PCC). 5094 patient assessments were collected at SARS-CoV-2 infection, and at 6, 12, 18, and 24 months of follow-up. Our model identifies distinct PCC phenotypes with patient trajectories impacted by age and sex. Our results highlight how LTA can enhance the interpretability of complex, time-resolved clinical data, support personalized patient monitoring and management, and accelerate therapeutic development for other PAISs, too.

Note:

Supplementary information The online version contains supplementary material available at https://doi.org/10.1038/s41467-026-68650-7

Pagina Web:

https://doi.org/10.1038/s41467-026-68650-7

Id prodotto:

149791

Handle IRIS:

11562/1182808

ultima modifica:

18 aprile 2026

Citazione bibliografica:

Gusinow, Roy; Górska, Anna; Canziani, Lorenzo Maria; Lopes-Rafegas, Iris; Alvarez Garavito, Carolina; Tami, Adriana; Gentilotti, Elisa; Sicuri, Elisa; Laouénan, Cédric; Ghosn, Jade; Florence, Aline-Marie; Lahfej, Nadhem; Mazzaferri, Fulvia; Del Piccolo, Lidia; Giannella, Maddalena; Toschi, Alice; Di Chiara, Michela; Caponcello, Maria Giulia; Palacios-Baena, Zaira R; Wold, Karin I; Rossi, Elisa; Tacconelli, Evelina; Hasenauer, Jan; Orchestra Study Group, ; Addis, Elena; Armellini, Maddalena; Azzini, Anna Maria; Barana, Benedetta; Bonato, Lucia; Carrara, Elena; Castelli, Alessandro; Cioli Puviani, Filippo; Conti, Michela; Cordioli, Raffaella; Cutone, Carmine; Davis, Ruth Joanna; De Nardo, Pasquale; Emiliani, Miriam; Esposito, Alessio; Fasan, Daniele; Fasani, Giada; Franchina, Giorgia; Garlasco, Jacopo; Gibbin, Enrico; Dall'O', Hermes Salvatore; Konishi De Toffoli, Chiara; Lambertenghi, Lorenza; Lattanzi, Federico; Leonardi, Andrea; Luca, Francesco; Maccarrone, Gaia; Mirandola, Massimo; Morra, Matteo; Nazeri, Alessandra; Rocchi, Matilde; Rosini, Giulia; Perlini, Chiara; Pezzani, Maria Diletta; Rovigo, Laura; Salvadori, Anna Giulia; Sartori, Andrea; Savoldi, Alessia; Scardellato, Rebecca; Sibani, Marcella; Sodano, Erica; Sorbello, Simona; Tavernaro, Lorenzo; Tomassini, Giorgia; Visentin, Alessandro; Vitali, Stefania; Volpe, Andrea; Zanchi, Chiara; Mazzali, Gloria; Stabile, Giovanni; Vantini, Gianluca; Cecchetto, Riccardo; Gibellini, Davide; Cardobi, Nicolò; Calì, Debora; Cecchini, Maria Paola; Marcanti, Maddalena; Mason, Anna; Monaco, Salvatore; Pattaro Zonta, Marco; Perlini, Cinzia; Zanusso, Gianluigi; Righi, Elda; Nunes Pinho Guedes, Mariana; Mongardi, Maria; Sciammarella, Concetta; Micheletto, Claudio; Gisondi, Paolo; Caroccia, Natascia; Bonazzetti, Cecilia; Tazza, Beatrice; Zeno Igor Adrien Pasquini, ; Marzolla, Domenico; Fornaro, Giacomo; Trapani, Fabio; Marconi, Lorenzo; Attard, Luciano; Tedeschi, Sara; Vituliano, Silvia; Gabrielli, Liliana; Lazzarotto, Tiziana; Rodrguez-Baño, Jesús; Mara Isabel Garcia Sánchez, ; Ana Belén Hidalgo Céspedes, ; Aurora Aleman Rodriguez, ; Lola Cubero Aranda, ; Paula Olivares Navarro, ; Sandra De La Rosa Riestra, ; José, M Bravo-Ferrero; Gerolf De Boer, ; Bernardina T, F Van Der Gun; Mara, F Vincenti-González; Alida C, M Veloo; Pantano, Daniele; Margriet Van Der Meer, ; Gard, Lilli; Erley, F Lizarazo; Knoester, Marjolein; Alex, W Friedrich; Hubert G, M Niesters; Cataudella, Salvatore; Dellacasa, Chiara; Huth, Manuel; Peiter, Clemens, Latent transition analysis for longitudinal studies of post-acute infection syndromes «NATURE COMMUNICATIONS» , vol. 17 , n. 1 , 2026 , pp. 1-15

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